Ученые ИЦиГ СО РАН работают над библиотекой геномов микроорганизмов.
Исследования в области биоинформатики составляют существенную часть научной работы, проводимой в рамках Курчатовского геномного центра мирового уровня, в число организаторов которого входит ФИЦ ИЦиГ СО РАН. Один из ключевых проектов – создание библиотеки моделей геномов на основе коллекций микроорганизмов, которыми располагают научные институты нашей страны. Такая библиотека станет мощным ресурсом для развития отечественной биотехнологической промышленности. «Секвенирование дает нам последовательность генов в ДНК организма, но это лишь первый шаг. Следующий этап заключается в построении на основе геномной информации метаболической карты организма, а также карты генетической регуляции, с помощью которой мы показываем, как взаимодействуют между собой гены. А затем, на основе этих карт, мы уже строим математические модели, где описываем, как происходит синтез определенного целевого продукта этим микроорганизмом», - рассказал ведущий научный сотрудник отделения «Курчатовский геномный центр ИЦиГ СО РАН», к.б.н. Сергей Лашин. В итоге, ученые получают не только достоверные данные о потенциале конкретной бактерии для производства тех или иных необходимых промышленности продуктов, но и понимание, как с помощью современных генетических технологий можно менять параметры этого процесса (например, повысить интенсивность синтеза вещества или изменить какие-то его характеристики). Проанализировав геномы двухсот с лишним микроорганизмов из коллекций, новосибирские биоинформатики отобрали 17 перспективных бактерий, которые теперь будут изучены более детально. Одна из главных задач на этом пути – оптимизация самого процесса подобного анализа и моделирования генома. Поэтому, параллельно с анализом геномов из коллекций, ведутся работы и над автоматизацией этой части исследований.